Потомственный парижанин Франсуа Куперен неспроста известен как Куперен Великий. Его отец Шарль, дядя Луи, да и трое его собственных детей также были заметными музыкантами, но своей славой Франсуа существенно превзошёл и своих предшественников, и потомков.
В возрасте 18 лет Франсуа Куперен стал преемником своего отца на посту органиста парижской церкви Сен-Жерве. К этому периоду относятся самые ранние из сохранившихся произведений Куперена – 2 органные мессы (1690). В 1693 году Куперен – один из 4 «королевских органистов» при дворе Людовика XIV; в 1702 – придворный учитель музыки. До начала 1710-х сочинял главным образом духовную и камерно-инструментальную музыку, которая принесла ему славу лучшего композитора Франции; эта слава укрепилась после 1713, когда начали публиковаться его клавесинные пьесы . В 1716 вышел в свет трактат «Искусство игры на клавесине», в котором изложены исполнительские принципы и эстетические взгляды композитора.
Среди произведений, созданных Купереном по заказу Людовика XIV, выделяются 4 «Королевских концерта» для различных сочетаний инструментов. В трио-сонатах 1690-х итальянские черты, обусловленные влиянием инструментальной музыки Корелли, оригинально сочетаются с богато украшенными мелодиями и насыщенными гармониями в самобытном французском стиле. Позднее Куперен опубликовал эти сонаты вместе с группами французских танцев под общим названием «Нации». Стремление Куперена к синтезу французского и итальянского стилей отразилось в его программных трио-сонатах («апофеозах») памяти Корелли и Люлли и в «Новых концертах» из сборника «Объединенные вкусы».
Самая известная часть наследия Куперена пьесы для клавесина. Между 1713 и 1730 им было опубликовано 4 сборника клавесинной музыки – всего около 220 пьес, объединенных в 27 сюит. Наряду с частями в форме традиционных французских танцев сюиты Куперена включают характерные пьесы, снабженные программными заголовками, среди которых есть и совершенно конкретные (указывающие на тот или иной человеческий тип, настроение, черту характера, явление природы и т. п.). Большинство характерных пьес Куперена написано в форме рондо. За их богатой, тщательно детализированной орнаментикой и грациозной ритмикой скрывается сложный мир многообразных эмоций и неуловимых, часто загадочных смыслов.
Музыкантами были и дети Куперена: сын Николя, что унаследовал его пост в церкви Сен-Жерве, и дочери Мари-Мадлен (органистка в женском монастыре) и Маргерит-Антуанетт (клавесинистка при дворе Людовика XV).